Na instalação do serviço e-Social pode ser selecionada a opção para gravar logs do serviço e caso seja marcado esse check-box em tela, habilita o diretório para que seja informado. Isso é explicado no artigo Como instalar o serviço do eSocial.
Mas após sua instalação é permitido alterar esse caminho, caso necessário.
Basta pausar o serviço no módulo eSocial/Gerenciamento, menu Monitoramento de lotes:
Depois busca o arquivo denominado Configurador SRHeSocial que está onde foi descompactado os arquivos da instalação (cada cliente salvou em local desejado durante a instalação, normalmente em c:\temp).
Ao acessá-lo vai exibir a seguinte tela (aba Preferências) permitindo alterar o diretório de logs. Após alterar basta clicar em salvar:
Ao final, retorne a tela de monitoramento de lotes e clique em retomar comunicação com o eSocial. A partir desse momento os logs começam a ser gravados no novo diretório.