Para não descontar a contribuição sindical dos funcionários existem 2 opções:
1) Acesse o menu: Cadastramento > Contrato, na aba Vínculos altere a Opção Contribuição Sindical para "Não contribui".
Exemplo:
2) Desative a fórmula de cálculo. Acesse Menu Arquivo > Fórmulas de Cálculo, localize a fórmula que Calcula Contribuição Sindical.
Importante: Caso tenha algum funcionário que concorde com o desconto, efetue o lançamento manual ou poderá contratar um serviço para adequação da fórmula.