Como o estágio é uma modalidade de aprendizagem e não configura uma relação de emprego formal, o estagiário não se enquadra nos critérios para receber o PIS.
O estagiário precisa ser informado no eSocial, porém o número do PIS continua não sendo obrigatório para ele, portanto poderá ficar em branco. Em seu cadastro é importante que a categoria esteja como estagiário.
Com estas configurações, os estagiários estarão prontos para o envio ao eSocial, mesmo com o campo PIS sem informações.