No módulo Frequência, ao acessar a tela de Acertos do Ponto, os dias ficam 'selecionados' conforme são clicados para visualizar as marcações.
Solução:
1. Acesse o menu Apuração > Acertos por Contrato e selecione o ponto de um dos funcionários.
2. Com o botão direito do mouse, clique sobre os dias do período do ponto e desmarque a opção 'Marcações'.
3. Logo em seguida clique novamente com o botão direito do mouse e volte a marcar a opção 'Marcações'.
Veja mais informações no material Como Ativar/Desativar Colunas na Tela de Acerto do Ponto.